हनुमानजी के जन्‍म के विषय में दूसरी कथा यह कथा शिव पुराण और अन्य क्षेत्रीय रामायणों (जैसे आनंद रामायण) में वर्णित हनुमान जी के जन्म के आध्यात्मिक रहस्य को उजागर करती है। यह कहानी सामान्य कथा से थोड़ी गहरी है क्योंकि यह भगवान शिव और भगवान विष्णु की सम्मिलित शक्ति को दर्शाती है। कथा के अनुसार, जब समुद्र मंथन के दौरान अमृत निकला, तो भगवान विष्णु ने असुरों को छलाने के लिए मोहिनी का अत्यंत सुंदर रूप धारण किया था। उस समय शिव जी वहाँ उपस्थित नहीं थे। बाद में, जब शिव जी ने सुना कि विष्णु जी ने इतना सुंदर रूप लिया है, तो उनके मन में उस रूप को देखने की जिज्ञासा जाग्रत हुई। शिव जी भगवान विष्णु के पास पहुँचे और उनसे मोहिनी रूप पुनः दिखाने का आग्रह किया।